Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ccl20O89093 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ccl20O89093 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ccl20O89093 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ccl20O89093 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ccl20O89093 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ccl20O89093 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ccl20O89093 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ccl20O89093 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ccl20O89093 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl20O89093 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ccl20O89093 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Ccl20O89093 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ccl20O89093 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ccl20O89093 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms