Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf5O70191 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf5O70191 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf5O70191 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf5O70191 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf5O70191 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf5O70191 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf5O70191 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf5O70191 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf5O70191 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf5O70191 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf5O70191 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf5O70191 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf5O70191 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf5O70191 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms