Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnk2O54967 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnk2O54967 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms