Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brs3O54798 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brs3O54798 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brs3O54798 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brs3O54798 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms