Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffbO54788 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffbO54788 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffbO54788 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffbO54788 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DffbO54788 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DffbO54788 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffbO54788 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffbO54788 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DffbO54788 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DffbO54788 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DffbO54788 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
DffbO54788 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DffbO54788 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DffbO54788 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffbO54788 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffbO54788 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffbO54788 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffbO54788 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffbO54788 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DffbO54788 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffbO54788 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffbO54788 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffbO54788 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffbO54788 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffbO54788 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffbO54788 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DffbO54788 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffbO54788 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffbO54788 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffbO54788 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffbO54788 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffbO54788 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffbO54788 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffbO54788 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffbO54788 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffbO54788 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffbO54788 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffbO54788 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DffbO54788 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffbO54788 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffbO54788 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DffbO54788 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DffbO54788 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffbO54788 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffbO54788 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffbO54788 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffbO54788 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffbO54788 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffbO54788 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffbO54788 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffbO54788 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffbO54788 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffbO54788 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffbO54788 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffbO54788 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DffbO54788 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffbO54788 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffbO54788 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffbO54788 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffbO54788 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffbO54788 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffbO54788 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffbO54788 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffbO54788 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffbO54788 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffbO54788 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffbO54788 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffbO54788 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffbO54788 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffbO54788 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffbO54788 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffbO54788 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffbO54788 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffbO54788 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffbO54788 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffbO54788 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffbO54788 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffbO54788 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffbO54788 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffbO54788 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffbO54788 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffbO54788 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffbO54788 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffbO54788 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffbO54788 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffbO54788 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffbO54788 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffbO54788 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffbO54788 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffbO54788 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffbO54788 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffbO54788 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffbO54788 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffbO54788 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffbO54788 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffbO54788 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DffbO54788 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffbO54788 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffbO54788 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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