Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sema6aO35464 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms