Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm20939L7N243 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm20939L7N243 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20939L7N243 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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