Protein–RNA interactions for Protein: J3QN10

Gm16434, Predicted gene 16434, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16434J3QN10 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16434J3QN10 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm16434J3QN10 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm16434J3QN10 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm16434J3QN10 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm16434J3QN10 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm16434J3QN10 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms