Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc179J3QM76 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms