Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17lcG5E8I7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17lcG5E8I7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp17lcG5E8I7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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