Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nccrp1G3X9C2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms