Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Speer4cG3UXD1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Speer4cG3UXD1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Speer4cG3UXD1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Speer4cG3UXD1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Speer4cG3UXD1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Speer4cG3UXD1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Speer4cG3UXD1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms