Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933403O08RikF6UK53 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933403O08RikF6UK53 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933403O08RikF6UK53 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933403O08RikF6UK53 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933403O08RikF6UK53 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933403O08RikF6UK53 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933403O08RikF6UK53 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933403O08RikF6UK53 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933403O08RikF6UK53 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933403O08RikF6UK53 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933403O08RikF6UK53 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms