Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm5407E9Q7Q1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm5407E9Q7Q1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm5407E9Q7Q1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms