Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdr1E9Q0B4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms