Protein–RNA interactions for Protein: E9PVP9

Gm4884, Predicted gene 4884, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4884E9PVP9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4884E9PVP9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4884E9PVP9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms