Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc62E9PVD1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc62E9PVD1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc62E9PVD1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc62E9PVD1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc62E9PVD1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc62E9PVD1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc62E9PVD1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc62E9PVD1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc62E9PVD1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc62E9PVD1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc62E9PVD1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc62E9PVD1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc62E9PVD1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc62E9PVD1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc62E9PVD1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms