Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20547B8JJN0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm20547B8JJN0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm20547B8JJN0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Gm20547B8JJN0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Gm20547B8JJN0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Gm20547B8JJN0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Gm20547B8JJN0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Gm20547B8JJN0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20547B8JJN0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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