Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms