Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cfap58B2RW38 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms