Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CK137956B1AYM9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CK137956B1AYM9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms