Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms