Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms