Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms