Protein–RNA interactions for Protein: A0A1Y7VIZ1

Platr25, Pluripotency-associated transcript 25, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Platr25A0A1Y7VIZ1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Platr25A0A1Y7VIZ1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Platr25A0A1Y7VIZ1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms