Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
A0A0U1RNP2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A0A0U1RNP2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A0A0U1RNP2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A0A0U1RNP2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A0A0U1RNP2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A0A0U1RNP2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A0A0U1RNP2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A0A0U1RNP2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms