Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm28036V9GXJ1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm28036V9GXJ1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm28036V9GXJ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm28036V9GXJ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm28036V9GXJ1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm28036V9GXJ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm28036V9GXJ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm28036V9GXJ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm28036V9GXJ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm28036V9GXJ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm28036V9GXJ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm28036V9GXJ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm28036V9GXJ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm28036V9GXJ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm28036V9GXJ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm28036V9GXJ1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm28036V9GXJ1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm28036V9GXJ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm28036V9GXJ1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm28036V9GXJ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm28036V9GXJ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Gm28036V9GXJ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm28036V9GXJ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm28036V9GXJ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm28036V9GXJ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm28036V9GXJ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm28036V9GXJ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm28036V9GXJ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm28036V9GXJ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm28036V9GXJ1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm28036V9GXJ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm28036V9GXJ1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm28036V9GXJ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm28036V9GXJ1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm28036V9GXJ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm28036V9GXJ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm28036V9GXJ1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm28036V9GXJ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm28036V9GXJ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm28036V9GXJ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm28036V9GXJ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm28036V9GXJ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm28036V9GXJ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm28036V9GXJ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm28036V9GXJ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm28036V9GXJ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm28036V9GXJ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm28036V9GXJ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm28036V9GXJ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm28036V9GXJ1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm28036V9GXJ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm28036V9GXJ1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm28036V9GXJ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm28036V9GXJ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm28036V9GXJ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm28036V9GXJ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm28036V9GXJ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm28036V9GXJ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm28036V9GXJ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm28036V9GXJ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm28036V9GXJ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm28036V9GXJ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm28036V9GXJ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm28036V9GXJ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm28036V9GXJ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm28036V9GXJ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm28036V9GXJ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm28036V9GXJ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gm28036V9GXJ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm28036V9GXJ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm28036V9GXJ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm28036V9GXJ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm28036V9GXJ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm28036V9GXJ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm28036V9GXJ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm28036V9GXJ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm28036V9GXJ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm28036V9GXJ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm28036V9GXJ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm28036V9GXJ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm28036V9GXJ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm28036V9GXJ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gm28036V9GXJ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.9 ms