Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mrpl40Q9Z2Q5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Mrpl40Q9Z2Q5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mrpl40Q9Z2Q5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrpl40Q9Z2Q5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl40Q9Z2Q5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl40Q9Z2Q5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrpl40Q9Z2Q5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mrpl40Q9Z2Q5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl40Q9Z2Q5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms