Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gipc2Q9Z2H7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gipc2Q9Z2H7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gipc2Q9Z2H7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gipc2Q9Z2H7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gipc2Q9Z2H7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gipc2Q9Z2H7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gipc2Q9Z2H7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gipc2Q9Z2H7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gipc2Q9Z2H7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gipc2Q9Z2H7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gipc2Q9Z2H7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gipc2Q9Z2H7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gipc2Q9Z2H7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gipc2Q9Z2H7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gipc2Q9Z2H7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gipc2Q9Z2H7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gipc2Q9Z2H7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gipc2Q9Z2H7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gipc2Q9Z2H7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gipc2Q9Z2H7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gipc2Q9Z2H7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gipc2Q9Z2H7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gipc2Q9Z2H7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gipc2Q9Z2H7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gipc2Q9Z2H7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gipc2Q9Z2H7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gipc2Q9Z2H7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gipc2Q9Z2H7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gipc2Q9Z2H7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gipc2Q9Z2H7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gipc2Q9Z2H7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gipc2Q9Z2H7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gipc2Q9Z2H7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gipc2Q9Z2H7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gipc2Q9Z2H7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gipc2Q9Z2H7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gipc2Q9Z2H7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gipc2Q9Z2H7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gipc2Q9Z2H7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gipc2Q9Z2H7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gipc2Q9Z2H7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gipc2Q9Z2H7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gipc2Q9Z2H7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gipc2Q9Z2H7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gipc2Q9Z2H7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gipc2Q9Z2H7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gipc2Q9Z2H7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gipc2Q9Z2H7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gipc2Q9Z2H7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gipc2Q9Z2H7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gipc2Q9Z2H7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gipc2Q9Z2H7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gipc2Q9Z2H7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gipc2Q9Z2H7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gipc2Q9Z2H7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gipc2Q9Z2H7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gipc2Q9Z2H7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gipc2Q9Z2H7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gipc2Q9Z2H7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gipc2Q9Z2H7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gipc2Q9Z2H7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gipc2Q9Z2H7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gipc2Q9Z2H7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gipc2Q9Z2H7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gipc2Q9Z2H7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gipc2Q9Z2H7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gipc2Q9Z2H7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gipc2Q9Z2H7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gipc2Q9Z2H7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gipc2Q9Z2H7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gipc2Q9Z2H7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gipc2Q9Z2H7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gipc2Q9Z2H7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gipc2Q9Z2H7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gipc2Q9Z2H7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gipc2Q9Z2H7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms