Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rlbp1Q9Z275 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rlbp1Q9Z275 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rlbp1Q9Z275 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rlbp1Q9Z275 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rlbp1Q9Z275 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rlbp1Q9Z275 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rlbp1Q9Z275 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rlbp1Q9Z275 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rlbp1Q9Z275 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rlbp1Q9Z275 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rlbp1Q9Z275 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rlbp1Q9Z275 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rlbp1Q9Z275 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rlbp1Q9Z275 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rlbp1Q9Z275 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rlbp1Q9Z275 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rlbp1Q9Z275 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rlbp1Q9Z275 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rlbp1Q9Z275 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rlbp1Q9Z275 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rlbp1Q9Z275 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rlbp1Q9Z275 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rlbp1Q9Z275 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rlbp1Q9Z275 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Rlbp1Q9Z275 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rlbp1Q9Z275 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rlbp1Q9Z275 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rlbp1Q9Z275 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rlbp1Q9Z275 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rlbp1Q9Z275 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rlbp1Q9Z275 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rlbp1Q9Z275 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rlbp1Q9Z275 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Rlbp1Q9Z275 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rlbp1Q9Z275 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rlbp1Q9Z275 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rlbp1Q9Z275 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rlbp1Q9Z275 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rlbp1Q9Z275 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rlbp1Q9Z275 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rlbp1Q9Z275 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rlbp1Q9Z275 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Rlbp1Q9Z275 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rlbp1Q9Z275 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rlbp1Q9Z275 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rlbp1Q9Z275 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rlbp1Q9Z275 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rlbp1Q9Z275 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rlbp1Q9Z275 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rlbp1Q9Z275 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rlbp1Q9Z275 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rlbp1Q9Z275 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rlbp1Q9Z275 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rlbp1Q9Z275 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rlbp1Q9Z275 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rlbp1Q9Z275 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rlbp1Q9Z275 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rlbp1Q9Z275 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Rlbp1Q9Z275 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rlbp1Q9Z275 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rlbp1Q9Z275 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rlbp1Q9Z275 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rlbp1Q9Z275 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rlbp1Q9Z275 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rlbp1Q9Z275 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rlbp1Q9Z275 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rlbp1Q9Z275 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Rlbp1Q9Z275 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rlbp1Q9Z275 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rlbp1Q9Z275 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rlbp1Q9Z275 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rlbp1Q9Z275 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rlbp1Q9Z275 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rlbp1Q9Z275 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rlbp1Q9Z275 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rlbp1Q9Z275 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rlbp1Q9Z275 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rlbp1Q9Z275 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rlbp1Q9Z275 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rlbp1Q9Z275 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rlbp1Q9Z275 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rlbp1Q9Z275 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rlbp1Q9Z275 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rlbp1Q9Z275 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rlbp1Q9Z275 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rlbp1Q9Z275 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rlbp1Q9Z275 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rlbp1Q9Z275 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rlbp1Q9Z275 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rlbp1Q9Z275 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rlbp1Q9Z275 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rlbp1Q9Z275 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rlbp1Q9Z275 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rlbp1Q9Z275 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rlbp1Q9Z275 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rlbp1Q9Z275 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rlbp1Q9Z275 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rlbp1Q9Z275 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rlbp1Q9Z275 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms