Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tulp1Q9Z273 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tulp1Q9Z273 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Tulp1Q9Z273 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tulp1Q9Z273 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tulp1Q9Z273 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tulp1Q9Z273 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tulp1Q9Z273 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tulp1Q9Z273 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tulp1Q9Z273 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tulp1Q9Z273 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tulp1Q9Z273 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tulp1Q9Z273 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Tulp1Q9Z273 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tulp1Q9Z273 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tulp1Q9Z273 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tulp1Q9Z273 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tulp1Q9Z273 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tulp1Q9Z273 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tulp1Q9Z273 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tulp1Q9Z273 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tulp1Q9Z273 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tulp1Q9Z273 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tulp1Q9Z273 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tulp1Q9Z273 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tulp1Q9Z273 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tulp1Q9Z273 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tulp1Q9Z273 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tulp1Q9Z273 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tulp1Q9Z273 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tulp1Q9Z273 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tulp1Q9Z273 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tulp1Q9Z273 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tulp1Q9Z273 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tulp1Q9Z273 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tulp1Q9Z273 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tulp1Q9Z273 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tulp1Q9Z273 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tulp1Q9Z273 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tulp1Q9Z273 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tulp1Q9Z273 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tulp1Q9Z273 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tulp1Q9Z273 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tulp1Q9Z273 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tulp1Q9Z273 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tulp1Q9Z273 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tulp1Q9Z273 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tulp1Q9Z273 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tulp1Q9Z273 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tulp1Q9Z273 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tulp1Q9Z273 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tulp1Q9Z273 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tulp1Q9Z273 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tulp1Q9Z273 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tulp1Q9Z273 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tulp1Q9Z273 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tulp1Q9Z273 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tulp1Q9Z273 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tulp1Q9Z273 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tulp1Q9Z273 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tulp1Q9Z273 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tulp1Q9Z273 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tulp1Q9Z273 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tulp1Q9Z273 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tulp1Q9Z273 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tulp1Q9Z273 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tulp1Q9Z273 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tulp1Q9Z273 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tulp1Q9Z273 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tulp1Q9Z273 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tulp1Q9Z273 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tulp1Q9Z273 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tulp1Q9Z273 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tulp1Q9Z273 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tulp1Q9Z273 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Tulp1Q9Z273 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tulp1Q9Z273 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tulp1Q9Z273 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tulp1Q9Z273 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tulp1Q9Z273 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tulp1Q9Z273 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tulp1Q9Z273 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tulp1Q9Z273 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tulp1Q9Z273 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tulp1Q9Z273 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tulp1Q9Z273 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tulp1Q9Z273 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tulp1Q9Z273 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tulp1Q9Z273 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tulp1Q9Z273 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tulp1Q9Z273 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tulp1Q9Z273 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tulp1Q9Z273 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Tulp1Q9Z273 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tulp1Q9Z273 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tulp1Q9Z273 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tulp1Q9Z273 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tulp1Q9Z273 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tulp1Q9Z273 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Tulp1Q9Z273 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms