Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z266

Snapin, SNARE-associated protein Snapin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnapinQ9Z266 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnapinQ9Z266 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnapinQ9Z266 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnapinQ9Z266 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnapinQ9Z266 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SnapinQ9Z266 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SnapinQ9Z266 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SnapinQ9Z266 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SnapinQ9Z266 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SnapinQ9Z266 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SnapinQ9Z266 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SnapinQ9Z266 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SnapinQ9Z266 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SnapinQ9Z266 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SnapinQ9Z266 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SnapinQ9Z266 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SnapinQ9Z266 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SnapinQ9Z266 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SnapinQ9Z266 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SnapinQ9Z266 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SnapinQ9Z266 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SnapinQ9Z266 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SnapinQ9Z266 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SnapinQ9Z266 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms