Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf394Q9Z1D9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf394Q9Z1D9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf394Q9Z1D9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf394Q9Z1D9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf394Q9Z1D9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf394Q9Z1D9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf394Q9Z1D9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf394Q9Z1D9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf394Q9Z1D9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf394Q9Z1D9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf394Q9Z1D9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf394Q9Z1D9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf394Q9Z1D9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf394Q9Z1D9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf394Q9Z1D9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf394Q9Z1D9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Znf394Q9Z1D9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf394Q9Z1D9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf394Q9Z1D9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf394Q9Z1D9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf394Q9Z1D9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf394Q9Z1D9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf394Q9Z1D9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf394Q9Z1D9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf394Q9Z1D9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf394Q9Z1D9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf394Q9Z1D9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf394Q9Z1D9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf394Q9Z1D9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf394Q9Z1D9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf394Q9Z1D9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf394Q9Z1D9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf394Q9Z1D9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf394Q9Z1D9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf394Q9Z1D9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf394Q9Z1D9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf394Q9Z1D9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf394Q9Z1D9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf394Q9Z1D9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf394Q9Z1D9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf394Q9Z1D9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf394Q9Z1D9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf394Q9Z1D9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Znf394Q9Z1D9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf394Q9Z1D9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf394Q9Z1D9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf394Q9Z1D9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf394Q9Z1D9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf394Q9Z1D9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf394Q9Z1D9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf394Q9Z1D9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf394Q9Z1D9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf394Q9Z1D9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf394Q9Z1D9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf394Q9Z1D9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf394Q9Z1D9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf394Q9Z1D9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf394Q9Z1D9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf394Q9Z1D9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Znf394Q9Z1D9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Znf394Q9Z1D9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf394Q9Z1D9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf394Q9Z1D9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf394Q9Z1D9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf394Q9Z1D9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf394Q9Z1D9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf394Q9Z1D9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf394Q9Z1D9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf394Q9Z1D9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf394Q9Z1D9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf394Q9Z1D9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf394Q9Z1D9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf394Q9Z1D9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf394Q9Z1D9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf394Q9Z1D9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf394Q9Z1D9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf394Q9Z1D9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Znf394Q9Z1D9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf394Q9Z1D9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf394Q9Z1D9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf394Q9Z1D9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms