Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z183

Padi4, Protein-arginine deiminase type-4, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi4Q9Z183 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Padi4Q9Z183 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Padi4Q9Z183 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Padi4Q9Z183 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Padi4Q9Z183 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Padi4Q9Z183 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Padi4Q9Z183 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Padi4Q9Z183 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Padi4Q9Z183 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Padi4Q9Z183 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Padi4Q9Z183 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Padi4Q9Z183 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Padi4Q9Z183 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Padi4Q9Z183 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Padi4Q9Z183 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Padi4Q9Z183 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Padi4Q9Z183 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Padi4Q9Z183 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Padi4Q9Z183 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Padi4Q9Z183 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Padi4Q9Z183 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Padi4Q9Z183 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Padi4Q9Z183 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Padi4Q9Z183 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Padi4Q9Z183 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Padi4Q9Z183 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Padi4Q9Z183 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Padi4Q9Z183 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Padi4Q9Z183 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Padi4Q9Z183 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Padi4Q9Z183 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Padi4Q9Z183 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Padi4Q9Z183 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Padi4Q9Z183 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Padi4Q9Z183 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Padi4Q9Z183 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Padi4Q9Z183 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Padi4Q9Z183 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Padi4Q9Z183 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Padi4Q9Z183 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Padi4Q9Z183 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Padi4Q9Z183 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Padi4Q9Z183 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Padi4Q9Z183 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Padi4Q9Z183 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Padi4Q9Z183 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Padi4Q9Z183 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Padi4Q9Z183 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Padi4Q9Z183 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Padi4Q9Z183 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Padi4Q9Z183 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Padi4Q9Z183 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Padi4Q9Z183 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Padi4Q9Z183 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Padi4Q9Z183 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Padi4Q9Z183 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Padi4Q9Z183 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Padi4Q9Z183 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Padi4Q9Z183 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Padi4Q9Z183 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Padi4Q9Z183 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Padi4Q9Z183 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Padi4Q9Z183 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Padi4Q9Z183 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Padi4Q9Z183 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Padi4Q9Z183 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Padi4Q9Z183 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Padi4Q9Z183 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Padi4Q9Z183 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Padi4Q9Z183 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Padi4Q9Z183 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Padi4Q9Z183 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Padi4Q9Z183 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Padi4Q9Z183 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Padi4Q9Z183 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Padi4Q9Z183 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Padi4Q9Z183 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Padi4Q9Z183 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Padi4Q9Z183 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Padi4Q9Z183 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Padi4Q9Z183 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Padi4Q9Z183 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Padi4Q9Z183 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Padi4Q9Z183 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Padi4Q9Z183 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Padi4Q9Z183 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Padi4Q9Z183 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Padi4Q9Z183 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Padi4Q9Z183 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Padi4Q9Z183 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Padi4Q9Z183 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Padi4Q9Z183 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Padi4Q9Z183 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Padi4Q9Z183 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Padi4Q9Z183 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Padi4Q9Z183 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Padi4Q9Z183 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Padi4Q9Z183 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Padi4Q9Z183 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Padi4Q9Z183 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms