Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xpr1Q9Z0U0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xpr1Q9Z0U0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xpr1Q9Z0U0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xpr1Q9Z0U0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xpr1Q9Z0U0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xpr1Q9Z0U0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xpr1Q9Z0U0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xpr1Q9Z0U0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xpr1Q9Z0U0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xpr1Q9Z0U0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xpr1Q9Z0U0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xpr1Q9Z0U0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xpr1Q9Z0U0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xpr1Q9Z0U0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xpr1Q9Z0U0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xpr1Q9Z0U0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xpr1Q9Z0U0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xpr1Q9Z0U0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xpr1Q9Z0U0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Xpr1Q9Z0U0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xpr1Q9Z0U0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xpr1Q9Z0U0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xpr1Q9Z0U0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xpr1Q9Z0U0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Xpr1Q9Z0U0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xpr1Q9Z0U0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xpr1Q9Z0U0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Xpr1Q9Z0U0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xpr1Q9Z0U0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xpr1Q9Z0U0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xpr1Q9Z0U0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xpr1Q9Z0U0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xpr1Q9Z0U0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xpr1Q9Z0U0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xpr1Q9Z0U0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xpr1Q9Z0U0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xpr1Q9Z0U0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xpr1Q9Z0U0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xpr1Q9Z0U0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xpr1Q9Z0U0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xpr1Q9Z0U0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xpr1Q9Z0U0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xpr1Q9Z0U0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xpr1Q9Z0U0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Xpr1Q9Z0U0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xpr1Q9Z0U0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xpr1Q9Z0U0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xpr1Q9Z0U0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xpr1Q9Z0U0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xpr1Q9Z0U0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xpr1Q9Z0U0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xpr1Q9Z0U0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xpr1Q9Z0U0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xpr1Q9Z0U0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xpr1Q9Z0U0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xpr1Q9Z0U0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xpr1Q9Z0U0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xpr1Q9Z0U0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xpr1Q9Z0U0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xpr1Q9Z0U0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Xpr1Q9Z0U0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xpr1Q9Z0U0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xpr1Q9Z0U0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xpr1Q9Z0U0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xpr1Q9Z0U0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xpr1Q9Z0U0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xpr1Q9Z0U0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xpr1Q9Z0U0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xpr1Q9Z0U0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xpr1Q9Z0U0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xpr1Q9Z0U0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xpr1Q9Z0U0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xpr1Q9Z0U0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Xpr1Q9Z0U0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Xpr1Q9Z0U0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Xpr1Q9Z0U0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Xpr1Q9Z0U0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xpr1Q9Z0U0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xpr1Q9Z0U0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xpr1Q9Z0U0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xpr1Q9Z0U0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xpr1Q9Z0U0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xpr1Q9Z0U0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xpr1Q9Z0U0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xpr1Q9Z0U0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xpr1Q9Z0U0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xpr1Q9Z0U0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xpr1Q9Z0U0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Xpr1Q9Z0U0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xpr1Q9Z0U0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xpr1Q9Z0U0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Xpr1Q9Z0U0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xpr1Q9Z0U0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Xpr1Q9Z0U0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xpr1Q9Z0U0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xpr1Q9Z0U0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xpr1Q9Z0U0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xpr1Q9Z0U0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Xpr1Q9Z0U0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms