Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carm1Q9WVG6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carm1Q9WVG6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Carm1Q9WVG6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Carm1Q9WVG6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Carm1Q9WVG6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Carm1Q9WVG6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Carm1Q9WVG6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Carm1Q9WVG6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Carm1Q9WVG6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Carm1Q9WVG6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Carm1Q9WVG6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Carm1Q9WVG6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Carm1Q9WVG6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Carm1Q9WVG6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Carm1Q9WVG6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Carm1Q9WVG6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Carm1Q9WVG6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Carm1Q9WVG6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Carm1Q9WVG6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Carm1Q9WVG6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Carm1Q9WVG6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Carm1Q9WVG6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Carm1Q9WVG6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Carm1Q9WVG6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Carm1Q9WVG6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Carm1Q9WVG6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Carm1Q9WVG6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Carm1Q9WVG6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Carm1Q9WVG6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Carm1Q9WVG6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Carm1Q9WVG6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Carm1Q9WVG6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Carm1Q9WVG6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carm1Q9WVG6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carm1Q9WVG6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carm1Q9WVG6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Carm1Q9WVG6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carm1Q9WVG6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carm1Q9WVG6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carm1Q9WVG6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carm1Q9WVG6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carm1Q9WVG6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carm1Q9WVG6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carm1Q9WVG6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carm1Q9WVG6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carm1Q9WVG6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carm1Q9WVG6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Carm1Q9WVG6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carm1Q9WVG6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carm1Q9WVG6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carm1Q9WVG6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carm1Q9WVG6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carm1Q9WVG6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carm1Q9WVG6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carm1Q9WVG6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Carm1Q9WVG6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Carm1Q9WVG6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carm1Q9WVG6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carm1Q9WVG6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carm1Q9WVG6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carm1Q9WVG6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carm1Q9WVG6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carm1Q9WVG6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carm1Q9WVG6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carm1Q9WVG6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carm1Q9WVG6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carm1Q9WVG6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carm1Q9WVG6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carm1Q9WVG6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carm1Q9WVG6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carm1Q9WVG6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carm1Q9WVG6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carm1Q9WVG6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carm1Q9WVG6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carm1Q9WVG6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carm1Q9WVG6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carm1Q9WVG6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carm1Q9WVG6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carm1Q9WVG6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carm1Q9WVG6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carm1Q9WVG6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Carm1Q9WVG6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Carm1Q9WVG6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carm1Q9WVG6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Carm1Q9WVG6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carm1Q9WVG6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carm1Q9WVG6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carm1Q9WVG6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carm1Q9WVG6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Carm1Q9WVG6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carm1Q9WVG6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carm1Q9WVG6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carm1Q9WVG6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carm1Q9WVG6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carm1Q9WVG6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carm1Q9WVG6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Carm1Q9WVG6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Carm1Q9WVG6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Carm1Q9WVG6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.4 ms