Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP7

Uchl5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl5Q9WUP7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Uchl5Q9WUP7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Uchl5Q9WUP7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Uchl5Q9WUP7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Uchl5Q9WUP7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uchl5Q9WUP7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Uchl5Q9WUP7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Uchl5Q9WUP7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uchl5Q9WUP7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uchl5Q9WUP7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Uchl5Q9WUP7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Uchl5Q9WUP7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Uchl5Q9WUP7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Uchl5Q9WUP7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Uchl5Q9WUP7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Uchl5Q9WUP7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Uchl5Q9WUP7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Uchl5Q9WUP7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uchl5Q9WUP7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uchl5Q9WUP7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uchl5Q9WUP7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Uchl5Q9WUP7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Uchl5Q9WUP7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Uchl5Q9WUP7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Uchl5Q9WUP7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Uchl5Q9WUP7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Uchl5Q9WUP7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Uchl5Q9WUP7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uchl5Q9WUP7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Uchl5Q9WUP7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Uchl5Q9WUP7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Uchl5Q9WUP7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Uchl5Q9WUP7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Uchl5Q9WUP7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Uchl5Q9WUP7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Uchl5Q9WUP7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Uchl5Q9WUP7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Uchl5Q9WUP7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Uchl5Q9WUP7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Uchl5Q9WUP7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Uchl5Q9WUP7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Uchl5Q9WUP7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Uchl5Q9WUP7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Uchl5Q9WUP7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Uchl5Q9WUP7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Uchl5Q9WUP7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Uchl5Q9WUP7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uchl5Q9WUP7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Uchl5Q9WUP7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Uchl5Q9WUP7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Uchl5Q9WUP7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Uchl5Q9WUP7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Uchl5Q9WUP7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Uchl5Q9WUP7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Uchl5Q9WUP7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uchl5Q9WUP7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uchl5Q9WUP7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uchl5Q9WUP7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uchl5Q9WUP7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uchl5Q9WUP7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Uchl5Q9WUP7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Uchl5Q9WUP7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Uchl5Q9WUP7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Uchl5Q9WUP7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uchl5Q9WUP7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uchl5Q9WUP7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uchl5Q9WUP7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Uchl5Q9WUP7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Uchl5Q9WUP7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Uchl5Q9WUP7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Uchl5Q9WUP7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Uchl5Q9WUP7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Uchl5Q9WUP7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Uchl5Q9WUP7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Uchl5Q9WUP7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Uchl5Q9WUP7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Uchl5Q9WUP7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Uchl5Q9WUP7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uchl5Q9WUP7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uchl5Q9WUP7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uchl5Q9WUP7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uchl5Q9WUP7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms