Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmed2Q9R0Q3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmed2Q9R0Q3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmed2Q9R0Q3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmed2Q9R0Q3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmed2Q9R0Q3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmed2Q9R0Q3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmed2Q9R0Q3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmed2Q9R0Q3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tmed2Q9R0Q3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmed2Q9R0Q3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmed2Q9R0Q3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmed2Q9R0Q3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmed2Q9R0Q3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmed2Q9R0Q3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmed2Q9R0Q3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmed2Q9R0Q3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed2Q9R0Q3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed2Q9R0Q3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmed2Q9R0Q3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmed2Q9R0Q3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmed2Q9R0Q3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmed2Q9R0Q3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmed2Q9R0Q3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmed2Q9R0Q3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmed2Q9R0Q3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmed2Q9R0Q3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmed2Q9R0Q3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmed2Q9R0Q3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmed2Q9R0Q3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmed2Q9R0Q3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmed2Q9R0Q3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmed2Q9R0Q3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed2Q9R0Q3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmed2Q9R0Q3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmed2Q9R0Q3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmed2Q9R0Q3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmed2Q9R0Q3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmed2Q9R0Q3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmed2Q9R0Q3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmed2Q9R0Q3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmed2Q9R0Q3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmed2Q9R0Q3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmed2Q9R0Q3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmed2Q9R0Q3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmed2Q9R0Q3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmed2Q9R0Q3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmed2Q9R0Q3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmed2Q9R0Q3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmed2Q9R0Q3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmed2Q9R0Q3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmed2Q9R0Q3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmed2Q9R0Q3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmed2Q9R0Q3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmed2Q9R0Q3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmed2Q9R0Q3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmed2Q9R0Q3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmed2Q9R0Q3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmed2Q9R0Q3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmed2Q9R0Q3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmed2Q9R0Q3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmed2Q9R0Q3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmed2Q9R0Q3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmed2Q9R0Q3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmed2Q9R0Q3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmed2Q9R0Q3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmed2Q9R0Q3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmed2Q9R0Q3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmed2Q9R0Q3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmed2Q9R0Q3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmed2Q9R0Q3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmed2Q9R0Q3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmed2Q9R0Q3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmed2Q9R0Q3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmed2Q9R0Q3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.8 ms