Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcm1Q9R0L6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcm1Q9R0L6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcm1Q9R0L6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcm1Q9R0L6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcm1Q9R0L6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcm1Q9R0L6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcm1Q9R0L6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcm1Q9R0L6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcm1Q9R0L6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcm1Q9R0L6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcm1Q9R0L6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcm1Q9R0L6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcm1Q9R0L6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcm1Q9R0L6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcm1Q9R0L6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcm1Q9R0L6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcm1Q9R0L6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcm1Q9R0L6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcm1Q9R0L6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcm1Q9R0L6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcm1Q9R0L6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcm1Q9R0L6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcm1Q9R0L6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcm1Q9R0L6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcm1Q9R0L6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcm1Q9R0L6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcm1Q9R0L6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcm1Q9R0L6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pcm1Q9R0L6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcm1Q9R0L6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcm1Q9R0L6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcm1Q9R0L6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcm1Q9R0L6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcm1Q9R0L6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcm1Q9R0L6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcm1Q9R0L6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcm1Q9R0L6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcm1Q9R0L6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcm1Q9R0L6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcm1Q9R0L6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcm1Q9R0L6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcm1Q9R0L6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcm1Q9R0L6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcm1Q9R0L6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcm1Q9R0L6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcm1Q9R0L6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcm1Q9R0L6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcm1Q9R0L6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcm1Q9R0L6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcm1Q9R0L6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcm1Q9R0L6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pcm1Q9R0L6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcm1Q9R0L6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcm1Q9R0L6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcm1Q9R0L6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcm1Q9R0L6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcm1Q9R0L6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcm1Q9R0L6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcm1Q9R0L6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcm1Q9R0L6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcm1Q9R0L6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcm1Q9R0L6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcm1Q9R0L6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcm1Q9R0L6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcm1Q9R0L6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcm1Q9R0L6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcm1Q9R0L6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcm1Q9R0L6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcm1Q9R0L6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcm1Q9R0L6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcm1Q9R0L6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcm1Q9R0L6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcm1Q9R0L6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pcm1Q9R0L6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcm1Q9R0L6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcm1Q9R0L6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcm1Q9R0L6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcm1Q9R0L6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcm1Q9R0L6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcm1Q9R0L6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcm1Q9R0L6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcm1Q9R0L6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcm1Q9R0L6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcm1Q9R0L6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcm1Q9R0L6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcm1Q9R0L6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcm1Q9R0L6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcm1Q9R0L6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcm1Q9R0L6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcm1Q9R0L6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcm1Q9R0L6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcm1Q9R0L6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcm1Q9R0L6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcm1Q9R0L6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcm1Q9R0L6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcm1Q9R0L6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcm1Q9R0L6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcm1Q9R0L6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcm1Q9R0L6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms