Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C0

Bloc1s6, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bloc1s6Q9R0C0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bloc1s6Q9R0C0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bloc1s6Q9R0C0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bloc1s6Q9R0C0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bloc1s6Q9R0C0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bloc1s6Q9R0C0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bloc1s6Q9R0C0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bloc1s6Q9R0C0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bloc1s6Q9R0C0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bloc1s6Q9R0C0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bloc1s6Q9R0C0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bloc1s6Q9R0C0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bloc1s6Q9R0C0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bloc1s6Q9R0C0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bloc1s6Q9R0C0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bloc1s6Q9R0C0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bloc1s6Q9R0C0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bloc1s6Q9R0C0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bloc1s6Q9R0C0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bloc1s6Q9R0C0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bloc1s6Q9R0C0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bloc1s6Q9R0C0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bloc1s6Q9R0C0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bloc1s6Q9R0C0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bloc1s6Q9R0C0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bloc1s6Q9R0C0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bloc1s6Q9R0C0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bloc1s6Q9R0C0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bloc1s6Q9R0C0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bloc1s6Q9R0C0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bloc1s6Q9R0C0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bloc1s6Q9R0C0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bloc1s6Q9R0C0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bloc1s6Q9R0C0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bloc1s6Q9R0C0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bloc1s6Q9R0C0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bloc1s6Q9R0C0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bloc1s6Q9R0C0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bloc1s6Q9R0C0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bloc1s6Q9R0C0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bloc1s6Q9R0C0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bloc1s6Q9R0C0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bloc1s6Q9R0C0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bloc1s6Q9R0C0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bloc1s6Q9R0C0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bloc1s6Q9R0C0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bloc1s6Q9R0C0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bloc1s6Q9R0C0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bloc1s6Q9R0C0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bloc1s6Q9R0C0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Bloc1s6Q9R0C0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bloc1s6Q9R0C0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bloc1s6Q9R0C0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bloc1s6Q9R0C0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Bloc1s6Q9R0C0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bloc1s6Q9R0C0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bloc1s6Q9R0C0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bloc1s6Q9R0C0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bloc1s6Q9R0C0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bloc1s6Q9R0C0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bloc1s6Q9R0C0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bloc1s6Q9R0C0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bloc1s6Q9R0C0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bloc1s6Q9R0C0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bloc1s6Q9R0C0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bloc1s6Q9R0C0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bloc1s6Q9R0C0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bloc1s6Q9R0C0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bloc1s6Q9R0C0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bloc1s6Q9R0C0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bloc1s6Q9R0C0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bloc1s6Q9R0C0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Bloc1s6Q9R0C0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bloc1s6Q9R0C0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bloc1s6Q9R0C0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bloc1s6Q9R0C0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bloc1s6Q9R0C0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bloc1s6Q9R0C0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bloc1s6Q9R0C0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bloc1s6Q9R0C0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms