Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Atp11cQ9QZW0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Atp11cQ9QZW0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
Atp11cQ9QZW0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Atp11cQ9QZW0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Atp11cQ9QZW0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Atp11cQ9QZW0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Atp11cQ9QZW0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Atp11cQ9QZW0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Atp11cQ9QZW0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Atp11cQ9QZW0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Atp11cQ9QZW0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Atp11cQ9QZW0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Atp11cQ9QZW0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Atp11cQ9QZW0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Atp11cQ9QZW0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Atp11cQ9QZW0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Atp11cQ9QZW0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Atp11cQ9QZW0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Atp11cQ9QZW0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Atp11cQ9QZW0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Atp11cQ9QZW0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Atp11cQ9QZW0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Atp11cQ9QZW0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Atp11cQ9QZW0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Atp11cQ9QZW0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Atp11cQ9QZW0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Atp11cQ9QZW0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Atp11cQ9QZW0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Atp11cQ9QZW0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Atp11cQ9QZW0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Atp11cQ9QZW0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Atp11cQ9QZW0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Atp11cQ9QZW0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Atp11cQ9QZW0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Atp11cQ9QZW0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Atp11cQ9QZW0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Atp11cQ9QZW0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Atp11cQ9QZW0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,39■■□□□ 1,65
Atp11cQ9QZW0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Atp11cQ9QZW0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Atp11cQ9QZW0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Atp11cQ9QZW0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Atp11cQ9QZW0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Atp11cQ9QZW0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Atp11cQ9QZW0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Atp11cQ9QZW0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Atp11cQ9QZW0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Atp11cQ9QZW0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Atp11cQ9QZW0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Atp11cQ9QZW0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Atp11cQ9QZW0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Atp11cQ9QZW0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Atp11cQ9QZW0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Atp11cQ9QZW0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Atp11cQ9QZW0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Atp11cQ9QZW0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Atp11cQ9QZW0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Atp11cQ9QZW0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Atp11cQ9QZW0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Atp11cQ9QZW0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Atp11cQ9QZW0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
Atp11cQ9QZW0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Atp11cQ9QZW0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Atp11cQ9QZW0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Atp11cQ9QZW0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Atp11cQ9QZW0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Atp11cQ9QZW0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Atp11cQ9QZW0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Atp11cQ9QZW0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Atp11cQ9QZW0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Atp11cQ9QZW0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Atp11cQ9QZW0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Atp11cQ9QZW0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
Atp11cQ9QZW0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Atp11cQ9QZW0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Atp11cQ9QZW0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Atp11cQ9QZW0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Atp11cQ9QZW0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Atp11cQ9QZW0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Atp11cQ9QZW0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms