Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcf1Q9QZM3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcf1Q9QZM3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcf1Q9QZM3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcf1Q9QZM3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcf1Q9QZM3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcf1Q9QZM3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcf1Q9QZM3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcf1Q9QZM3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcf1Q9QZM3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcf1Q9QZM3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcf1Q9QZM3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcf1Q9QZM3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcf1Q9QZM3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcf1Q9QZM3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcf1Q9QZM3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcf1Q9QZM3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcf1Q9QZM3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcf1Q9QZM3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcf1Q9QZM3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcf1Q9QZM3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcf1Q9QZM3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcf1Q9QZM3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcf1Q9QZM3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcf1Q9QZM3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcf1Q9QZM3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcf1Q9QZM3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcf1Q9QZM3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcf1Q9QZM3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcf1Q9QZM3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcf1Q9QZM3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcf1Q9QZM3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcf1Q9QZM3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcf1Q9QZM3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcf1Q9QZM3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcf1Q9QZM3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcf1Q9QZM3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcf1Q9QZM3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clcf1Q9QZM3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clcf1Q9QZM3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clcf1Q9QZM3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcf1Q9QZM3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcf1Q9QZM3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcf1Q9QZM3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcf1Q9QZM3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcf1Q9QZM3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcf1Q9QZM3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcf1Q9QZM3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcf1Q9QZM3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcf1Q9QZM3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcf1Q9QZM3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcf1Q9QZM3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcf1Q9QZM3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcf1Q9QZM3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcf1Q9QZM3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcf1Q9QZM3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcf1Q9QZM3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcf1Q9QZM3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcf1Q9QZM3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcf1Q9QZM3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcf1Q9QZM3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcf1Q9QZM3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcf1Q9QZM3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcf1Q9QZM3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcf1Q9QZM3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcf1Q9QZM3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcf1Q9QZM3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcf1Q9QZM3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcf1Q9QZM3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcf1Q9QZM3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcf1Q9QZM3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcf1Q9QZM3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcf1Q9QZM3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcf1Q9QZM3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcf1Q9QZM3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clcf1Q9QZM3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcf1Q9QZM3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcf1Q9QZM3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcf1Q9QZM3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcf1Q9QZM3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcf1Q9QZM3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clcf1Q9QZM3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clcf1Q9QZM3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clcf1Q9QZM3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcf1Q9QZM3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcf1Q9QZM3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clcf1Q9QZM3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcf1Q9QZM3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcf1Q9QZM3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clcf1Q9QZM3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcf1Q9QZM3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcf1Q9QZM3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcf1Q9QZM3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcf1Q9QZM3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcf1Q9QZM3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcf1Q9QZM3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcf1Q9QZM3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcf1Q9QZM3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcf1Q9QZM3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcf1Q9QZM3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms