Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Tnnt3Q9QZ47 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,89■■■□□ 2,86
Tnnt3Q9QZ47 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,85
Tnnt3Q9QZ47 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Tnnt3Q9QZ47 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Tnnt3Q9QZ47 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Tnnt3Q9QZ47 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Tnnt3Q9QZ47 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Tnnt3Q9QZ47 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Tnnt3Q9QZ47 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,83■■■□□ 2,85
Tnnt3Q9QZ47 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32,82■■■□□ 2,85
Tnnt3Q9QZ47 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Tnnt3Q9QZ47 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Tnnt3Q9QZ47 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Tnnt3Q9QZ47 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,79■■■□□ 2,84
Tnnt3Q9QZ47 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,78■■■□□ 2,84
Tnnt3Q9QZ47 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32,78■■■□□ 2,84
Tnnt3Q9QZ47 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Tnnt3Q9QZ47 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Tnnt3Q9QZ47 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Tnnt3Q9QZ47 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32,76■■■□□ 2,84
Tnnt3Q9QZ47 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Tnnt3Q9QZ47 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Tnnt3Q9QZ47 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Tnnt3Q9QZ47 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Tnnt3Q9QZ47 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Tnnt3Q9QZ47 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Tnnt3Q9QZ47 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Tnnt3Q9QZ47 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Tnnt3Q9QZ47 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32,72■■■□□ 2,83
Tnnt3Q9QZ47 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32,71■■■□□ 2,83
Tnnt3Q9QZ47 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Tnnt3Q9QZ47 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,7■■■□□ 2,83
Tnnt3Q9QZ47 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,82
Tnnt3Q9QZ47 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,69■■■□□ 2,82
Tnnt3Q9QZ47 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32,68■■■□□ 2,82
Tnnt3Q9QZ47 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Tnnt3Q9QZ47 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Tnnt3Q9QZ47 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Tnnt3Q9QZ47 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Tnnt3Q9QZ47 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Tnnt3Q9QZ47 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,66■■■□□ 2,82
Tnnt3Q9QZ47 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Tnnt3Q9QZ47 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Tnnt3Q9QZ47 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32,64■■■□□ 2,82
Tnnt3Q9QZ47 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Tnnt3Q9QZ47 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Tnnt3Q9QZ47 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Tnnt3Q9QZ47 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32,61■■■□□ 2,81
Tnnt3Q9QZ47 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32,61■■■□□ 2,81
Tnnt3Q9QZ47 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Tnnt3Q9QZ47 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Tnnt3Q9QZ47 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32,59■■■□□ 2,81
Tnnt3Q9QZ47 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Tnnt3Q9QZ47 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32,58■■■□□ 2,81
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Tnnt3Q9QZ47 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Tnnt3Q9QZ47 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Tnnt3Q9QZ47 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Tnnt3Q9QZ47 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Tnnt3Q9QZ47 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Tnnt3Q9QZ47 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32,54■■■□□ 2,8
Tnnt3Q9QZ47 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Tnnt3Q9QZ47 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Tnnt3Q9QZ47 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Tnnt3Q9QZ47 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,52■■■□□ 2,8
Tnnt3Q9QZ47 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Tnnt3Q9QZ47 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Tnnt3Q9QZ47 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Tnnt3Q9QZ47 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Tnnt3Q9QZ47 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32,49■■■□□ 2,79
Tnnt3Q9QZ47 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Tnnt3Q9QZ47 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Tnnt3Q9QZ47 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Tnnt3Q9QZ47 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Tnnt3Q9QZ47 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Tnnt3Q9QZ47 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Tnnt3Q9QZ47 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Tnnt3Q9QZ47 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Tnnt3Q9QZ47 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Tnnt3Q9QZ47 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Tnnt3Q9QZ47 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Tnnt3Q9QZ47 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Tnnt3Q9QZ47 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Tnnt3Q9QZ47 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,41■■■□□ 2,78
Tnnt3Q9QZ47 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Tnnt3Q9QZ47 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,38■■■□□ 2,77
Tnnt3Q9QZ47 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32,38■■■□□ 2,77
Tnnt3Q9QZ47 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Tnnt3Q9QZ47 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Tnnt3Q9QZ47 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Tnnt3Q9QZ47 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Tnnt3Q9QZ47 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Tnnt3Q9QZ47 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Tnnt3Q9QZ47 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Tnnt3Q9QZ47 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Tnnt3Q9QZ47 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,7 ms