Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Six6Q9QZ28 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Six6Q9QZ28 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Six6Q9QZ28 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Six6Q9QZ28 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Six6Q9QZ28 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Six6Q9QZ28 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Six6Q9QZ28 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Six6Q9QZ28 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Six6Q9QZ28 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Six6Q9QZ28 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Six6Q9QZ28 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Six6Q9QZ28 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Six6Q9QZ28 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Six6Q9QZ28 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Six6Q9QZ28 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Six6Q9QZ28 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Six6Q9QZ28 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Six6Q9QZ28 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Six6Q9QZ28 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Six6Q9QZ28 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Six6Q9QZ28 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Six6Q9QZ28 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Six6Q9QZ28 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Six6Q9QZ28 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Six6Q9QZ28 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Six6Q9QZ28 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Six6Q9QZ28 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Six6Q9QZ28 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Six6Q9QZ28 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Six6Q9QZ28 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Six6Q9QZ28 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Six6Q9QZ28 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Six6Q9QZ28 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Six6Q9QZ28 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Six6Q9QZ28 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Six6Q9QZ28 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Six6Q9QZ28 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Six6Q9QZ28 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Six6Q9QZ28 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Six6Q9QZ28 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Six6Q9QZ28 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Six6Q9QZ28 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Six6Q9QZ28 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Six6Q9QZ28 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Six6Q9QZ28 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Six6Q9QZ28 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Six6Q9QZ28 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Six6Q9QZ28 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Six6Q9QZ28 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms