Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpastQ9QYY8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpastQ9QYY8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SpastQ9QYY8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SpastQ9QYY8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SpastQ9QYY8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpastQ9QYY8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpastQ9QYY8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpastQ9QYY8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpastQ9QYY8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpastQ9QYY8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpastQ9QYY8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SpastQ9QYY8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpastQ9QYY8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpastQ9QYY8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpastQ9QYY8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SpastQ9QYY8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SpastQ9QYY8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SpastQ9QYY8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SpastQ9QYY8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SpastQ9QYY8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SpastQ9QYY8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpastQ9QYY8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpastQ9QYY8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpastQ9QYY8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpastQ9QYY8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpastQ9QYY8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SpastQ9QYY8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SpastQ9QYY8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SpastQ9QYY8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SpastQ9QYY8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SpastQ9QYY8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SpastQ9QYY8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SpastQ9QYY8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SpastQ9QYY8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpastQ9QYY8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpastQ9QYY8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SpastQ9QYY8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpastQ9QYY8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpastQ9QYY8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpastQ9QYY8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpastQ9QYY8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpastQ9QYY8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpastQ9QYY8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpastQ9QYY8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpastQ9QYY8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpastQ9QYY8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpastQ9QYY8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpastQ9QYY8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpastQ9QYY8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpastQ9QYY8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpastQ9QYY8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpastQ9QYY8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SpastQ9QYY8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpastQ9QYY8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpastQ9QYY8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpastQ9QYY8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpastQ9QYY8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpastQ9QYY8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SpastQ9QYY8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SpastQ9QYY8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SpastQ9QYY8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SpastQ9QYY8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SpastQ9QYY8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SpastQ9QYY8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SpastQ9QYY8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SpastQ9QYY8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SpastQ9QYY8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SpastQ9QYY8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SpastQ9QYY8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SpastQ9QYY8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SpastQ9QYY8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SpastQ9QYY8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SpastQ9QYY8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SpastQ9QYY8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpastQ9QYY8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpastQ9QYY8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpastQ9QYY8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpastQ9QYY8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpastQ9QYY8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SpastQ9QYY8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpastQ9QYY8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms