Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Irx4Q9QY61 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Irx4Q9QY61 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1,91
Irx4Q9QY61 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Irx4Q9QY61 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Irx4Q9QY61 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Irx4Q9QY61 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Irx4Q9QY61 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Irx4Q9QY61 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Irx4Q9QY61 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Irx4Q9QY61 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Irx4Q9QY61 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Irx4Q9QY61 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Irx4Q9QY61 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Irx4Q9QY61 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Irx4Q9QY61 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Irx4Q9QY61 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Irx4Q9QY61 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Irx4Q9QY61 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Irx4Q9QY61 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Irx4Q9QY61 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Irx4Q9QY61 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Irx4Q9QY61 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Irx4Q9QY61 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Irx4Q9QY61 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Irx4Q9QY61 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Irx4Q9QY61 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26,87■■□□□ 1,89
Irx4Q9QY61 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Irx4Q9QY61 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Irx4Q9QY61 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Irx4Q9QY61 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Irx4Q9QY61 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Irx4Q9QY61 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,82■■□□□ 1,88
Irx4Q9QY61 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Irx4Q9QY61 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Irx4Q9QY61 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Irx4Q9QY61 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Irx4Q9QY61 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Irx4Q9QY61 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Irx4Q9QY61 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Irx4Q9QY61 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Irx4Q9QY61 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Irx4Q9QY61 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
Irx4Q9QY61 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Irx4Q9QY61 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Irx4Q9QY61 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Irx4Q9QY61 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Irx4Q9QY61 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Irx4Q9QY61 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Irx4Q9QY61 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Irx4Q9QY61 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Irx4Q9QY61 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Irx4Q9QY61 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Irx4Q9QY61 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Irx4Q9QY61 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Irx4Q9QY61 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Irx4Q9QY61 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Irx4Q9QY61 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Irx4Q9QY61 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Irx4Q9QY61 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Irx4Q9QY61 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Irx4Q9QY61 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Irx4Q9QY61 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Irx4Q9QY61 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Irx4Q9QY61 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Irx4Q9QY61 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Irx4Q9QY61 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,63■■□□□ 1,85
Irx4Q9QY61 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26,63■■□□□ 1,85
Irx4Q9QY61 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Irx4Q9QY61 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Irx4Q9QY61 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Irx4Q9QY61 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Irx4Q9QY61 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Irx4Q9QY61 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Irx4Q9QY61 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Irx4Q9QY61 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Irx4Q9QY61 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Irx4Q9QY61 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Irx4Q9QY61 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Irx4Q9QY61 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Irx4Q9QY61 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Irx4Q9QY61 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Irx4Q9QY61 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Irx4Q9QY61 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Irx4Q9QY61 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Irx4Q9QY61 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Irx4Q9QY61 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Irx4Q9QY61 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Irx4Q9QY61 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Irx4Q9QY61 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Irx4Q9QY61 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Irx4Q9QY61 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Irx4Q9QY61 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Irx4Q9QY61 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Irx4Q9QY61 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Irx4Q9QY61 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Irx4Q9QY61 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Irx4Q9QY61 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Irx4Q9QY61 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Irx4Q9QY61 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms