Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim44Q9QXA7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim44Q9QXA7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim44Q9QXA7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim44Q9QXA7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim44Q9QXA7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim44Q9QXA7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim44Q9QXA7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim44Q9QXA7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim44Q9QXA7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim44Q9QXA7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim44Q9QXA7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim44Q9QXA7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim44Q9QXA7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim44Q9QXA7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim44Q9QXA7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trim44Q9QXA7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trim44Q9QXA7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim44Q9QXA7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trim44Q9QXA7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trim44Q9QXA7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trim44Q9QXA7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trim44Q9QXA7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trim44Q9QXA7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trim44Q9QXA7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim44Q9QXA7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim44Q9QXA7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim44Q9QXA7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim44Q9QXA7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim44Q9QXA7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim44Q9QXA7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim44Q9QXA7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trim44Q9QXA7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim44Q9QXA7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim44Q9QXA7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim44Q9QXA7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim44Q9QXA7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim44Q9QXA7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim44Q9QXA7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim44Q9QXA7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim44Q9QXA7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim44Q9QXA7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim44Q9QXA7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim44Q9QXA7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim44Q9QXA7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim44Q9QXA7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim44Q9QXA7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim44Q9QXA7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim44Q9QXA7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim44Q9QXA7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim44Q9QXA7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim44Q9QXA7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim44Q9QXA7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim44Q9QXA7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim44Q9QXA7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim44Q9QXA7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim44Q9QXA7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim44Q9QXA7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim44Q9QXA7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim44Q9QXA7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim44Q9QXA7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim44Q9QXA7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim44Q9QXA7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim44Q9QXA7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim44Q9QXA7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim44Q9QXA7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim44Q9QXA7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim44Q9QXA7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim44Q9QXA7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim44Q9QXA7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim44Q9QXA7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim44Q9QXA7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim44Q9QXA7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim44Q9QXA7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Trim44Q9QXA7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim44Q9QXA7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim44Q9QXA7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim44Q9QXA7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim44Q9QXA7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim44Q9QXA7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim44Q9QXA7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim44Q9QXA7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim44Q9QXA7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim44Q9QXA7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim44Q9QXA7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim44Q9QXA7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim44Q9QXA7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Trim44Q9QXA7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim44Q9QXA7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim44Q9QXA7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim44Q9QXA7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim44Q9QXA7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim44Q9QXA7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim44Q9QXA7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim44Q9QXA7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim44Q9QXA7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trim44Q9QXA7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim44Q9QXA7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim44Q9QXA7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim44Q9QXA7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms