Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpc4Q9QUQ5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc4Q9QUQ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc4Q9QUQ5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc4Q9QUQ5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc4Q9QUQ5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc4Q9QUQ5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc4Q9QUQ5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc4Q9QUQ5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc4Q9QUQ5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpc4Q9QUQ5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpc4Q9QUQ5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpc4Q9QUQ5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc4Q9QUQ5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc4Q9QUQ5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc4Q9QUQ5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc4Q9QUQ5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc4Q9QUQ5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc4Q9QUQ5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc4Q9QUQ5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trpc4Q9QUQ5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc4Q9QUQ5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpc4Q9QUQ5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpc4Q9QUQ5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpc4Q9QUQ5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc4Q9QUQ5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc4Q9QUQ5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc4Q9QUQ5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc4Q9QUQ5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc4Q9QUQ5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc4Q9QUQ5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc4Q9QUQ5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc4Q9QUQ5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpc4Q9QUQ5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpc4Q9QUQ5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpc4Q9QUQ5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpc4Q9QUQ5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc4Q9QUQ5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc4Q9QUQ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc4Q9QUQ5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc4Q9QUQ5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc4Q9QUQ5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc4Q9QUQ5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc4Q9QUQ5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc4Q9QUQ5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trpc4Q9QUQ5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trpc4Q9QUQ5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpc4Q9QUQ5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc4Q9QUQ5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc4Q9QUQ5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc4Q9QUQ5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc4Q9QUQ5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc4Q9QUQ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc4Q9QUQ5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc4Q9QUQ5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc4Q9QUQ5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc4Q9QUQ5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc4Q9QUQ5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpc4Q9QUQ5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpc4Q9QUQ5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpc4Q9QUQ5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpc4Q9QUQ5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpc4Q9QUQ5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc4Q9QUQ5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc4Q9QUQ5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc4Q9QUQ5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc4Q9QUQ5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc4Q9QUQ5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc4Q9QUQ5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc4Q9QUQ5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpc4Q9QUQ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpc4Q9QUQ5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc4Q9QUQ5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc4Q9QUQ5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc4Q9QUQ5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc4Q9QUQ5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpc4Q9QUQ5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc4Q9QUQ5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc4Q9QUQ5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc4Q9QUQ5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc4Q9QUQ5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc4Q9QUQ5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc4Q9QUQ5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc4Q9QUQ5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc4Q9QUQ5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc4Q9QUQ5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc4Q9QUQ5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc4Q9QUQ5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc4Q9QUQ5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc4Q9QUQ5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc4Q9QUQ5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc4Q9QUQ5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc4Q9QUQ5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc4Q9QUQ5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc4Q9QUQ5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc4Q9QUQ5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc4Q9QUQ5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc4Q9QUQ5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc4Q9QUQ5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trpc4Q9QUQ5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms