Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dkk3Q9QUN9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dkk3Q9QUN9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dkk3Q9QUN9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dkk3Q9QUN9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dkk3Q9QUN9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dkk3Q9QUN9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dkk3Q9QUN9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dkk3Q9QUN9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dkk3Q9QUN9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dkk3Q9QUN9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dkk3Q9QUN9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dkk3Q9QUN9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dkk3Q9QUN9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dkk3Q9QUN9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dkk3Q9QUN9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dkk3Q9QUN9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dkk3Q9QUN9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dkk3Q9QUN9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dkk3Q9QUN9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dkk3Q9QUN9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dkk3Q9QUN9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dkk3Q9QUN9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dkk3Q9QUN9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dkk3Q9QUN9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Dkk3Q9QUN9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dkk3Q9QUN9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dkk3Q9QUN9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dkk3Q9QUN9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dkk3Q9QUN9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dkk3Q9QUN9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dkk3Q9QUN9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Dkk3Q9QUN9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dkk3Q9QUN9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dkk3Q9QUN9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dkk3Q9QUN9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dkk3Q9QUN9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dkk3Q9QUN9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dkk3Q9QUN9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dkk3Q9QUN9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Dkk3Q9QUN9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dkk3Q9QUN9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dkk3Q9QUN9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dkk3Q9QUN9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dkk3Q9QUN9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dkk3Q9QUN9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dkk3Q9QUN9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dkk3Q9QUN9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dkk3Q9QUN9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dkk3Q9QUN9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dkk3Q9QUN9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dkk3Q9QUN9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dkk3Q9QUN9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dkk3Q9QUN9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dkk3Q9QUN9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dkk3Q9QUN9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dkk3Q9QUN9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dkk3Q9QUN9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dkk3Q9QUN9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dkk3Q9QUN9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dkk3Q9QUN9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dkk3Q9QUN9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dkk3Q9QUN9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dkk3Q9QUN9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dkk3Q9QUN9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dkk3Q9QUN9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dkk3Q9QUN9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dkk3Q9QUN9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dkk3Q9QUN9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms