Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Msh5Q9QUM7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Msh5Q9QUM7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msh5Q9QUM7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msh5Q9QUM7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Msh5Q9QUM7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msh5Q9QUM7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msh5Q9QUM7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msh5Q9QUM7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msh5Q9QUM7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msh5Q9QUM7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Msh5Q9QUM7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msh5Q9QUM7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msh5Q9QUM7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msh5Q9QUM7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Msh5Q9QUM7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Msh5Q9QUM7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Msh5Q9QUM7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msh5Q9QUM7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msh5Q9QUM7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msh5Q9QUM7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msh5Q9QUM7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Msh5Q9QUM7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Msh5Q9QUM7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Msh5Q9QUM7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Msh5Q9QUM7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Msh5Q9QUM7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Msh5Q9QUM7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Msh5Q9QUM7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Msh5Q9QUM7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Msh5Q9QUM7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Msh5Q9QUM7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Msh5Q9QUM7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Msh5Q9QUM7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Msh5Q9QUM7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Msh5Q9QUM7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Msh5Q9QUM7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Msh5Q9QUM7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Msh5Q9QUM7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Msh5Q9QUM7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Msh5Q9QUM7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Msh5Q9QUM7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msh5Q9QUM7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msh5Q9QUM7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msh5Q9QUM7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msh5Q9QUM7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msh5Q9QUM7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Msh5Q9QUM7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msh5Q9QUM7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msh5Q9QUM7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msh5Q9QUM7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msh5Q9QUM7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Msh5Q9QUM7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Msh5Q9QUM7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msh5Q9QUM7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msh5Q9QUM7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msh5Q9QUM7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Msh5Q9QUM7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Msh5Q9QUM7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msh5Q9QUM7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Msh5Q9QUM7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msh5Q9QUM7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msh5Q9QUM7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msh5Q9QUM7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msh5Q9QUM7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msh5Q9QUM7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Msh5Q9QUM7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Msh5Q9QUM7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Msh5Q9QUM7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Msh5Q9QUM7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Msh5Q9QUM7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msh5Q9QUM7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msh5Q9QUM7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msh5Q9QUM7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msh5Q9QUM7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msh5Q9QUM7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msh5Q9QUM7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msh5Q9QUM7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Msh5Q9QUM7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Msh5Q9QUM7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Msh5Q9QUM7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms